摘要 文昌魚 Hox 簇通常被視為脊索動物譜系的「原型」

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• 類型：已發表論文
• 日期：2022-09-02

摘要

文昌魚 Hox 簇通常被視為脊索動物譜系的「原型」。在這裡，我們對橫跨佛羅裡達文昌魚 Hox 簇（從 Hox14 到 Hox1）的 448 kb 區域進行了描述性描述。我們提供了先前描述的所有 14 個文昌魚序列的完整編碼序列，並對保守的非編碼調控序列元件進行了詳細分析。我們發現Hox簇的後部衍生得如此之高，以至於即使完整的基因組序列也不足以決定後部Hox基因是否由獨立複製產生，或者它們是否是相應顎口類同源基因組的真正的直系同源物。相比之下，前部區域保存得更好。文昌魚 Hox 簇強烈排除重複元素，但後部區域的兩個重複島除外。在頜口動物中也觀察到重複排除，但在原口動物 Hox 簇中沒有觀察到。因此，我們假設，較短的脊椎動物Hox簇是基因組複製後調節DNA冗餘的廣泛解決的結果，而不是從Hox簇中去除非功能序列的選擇壓力的結果。