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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
新型 microRNA (miRNA) 基因的計算鑑定是生物資訊學中的一項具有挑戰性的任務。必須使用自動化計算管道分析來描述未知功能 RNA 轉錄本的大量數據，以尋找推定的 miRNA 候選者。除了那些符合經典定義的 miRNA 之外，高通量定序技術還揭示了透過替代生物發生途徑衍生的其他 miRNA 樣分子。對這些數據進行詳盡的生物資訊分析涉及統計問題以及精確的序列和結構檢查，不僅包括功能成熟部分，還包括推定 miRNA 的整個前體序列。除了大量的物種特異性 miRNA 外，所有這些基因中的大多數至少在密切相關的生物體中是保守的。然而，一些 miRNA 可以追溯到真核物種進化的非常早期的階段。因此，對新發現的 miRNA 候選者的保守性的研究構成了 miRNA 計算註釋的重要一步。本章涵蓋的主題包括對 miRNA 註釋和家族定義的明顯問題的回顧、計算 miRNA 註釋或檢測的推薦流程，以及目前用於預測 miRNA 的電腦工具及其局限性的概述。本章最後討論了這些生物資訊學方法如何解決忠實的 miRNA 預測和正確註釋的問題。