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論文資訊
- 類型:已發表論文
- 日期:2022-09-02
摘要
新的蛋白質編碼基因可以透過修改現有基因或從頭產生。最近,雖然從頭起源的真核基因相對罕見且難以識別,但真核生物中從頭起源的重要性已被認識。相較之下,病毒含有許多從頭基因,即現有基因被新的開放閱讀框“套印”,這一過程會產生與祖先基因重疊的新蛋白質編碼基因。我們分析了 12 個經過實驗驗證的從頭起源的病毒基因的演化,並估計了它們的相對年齡。我們發現年輕的從頭基因與基因組的其餘部分有不同的密碼子使用。它們進化迅速,並處於正或弱的純化選擇之下。因此,年輕的從頭基因可能具有菌株特異性功能,或者沒有功能,使用當前依賴純化序列特徵的基因組註釋方法很難檢測到!選擇。與年輕的從頭基因相比,較老的從頭基因的密碼子使用與基因組的其餘部分相似。它們進化緩慢,並受到更強的淨化選擇。一些最古老的從頭基因在比它們重疊的祖先基因更強的選擇壓力下進化,這表明祖先基因和從頭基因之間存在進化拉鋸戰。