聖塔非研究所

摘要 有效族群規模(N e)決定了遺傳漂變的強度和多種基因型共同感染的頻率,使其成為病毒演化的關鍵因素

2022-09-02 · 已發表論文 · 更新 2026/03/19 上午03:43

摘要 有效族群規模(N e)決定了遺傳漂變的強度和多種基因型共同感染的頻率,使其成為病毒演化的關鍵因素。然而,不同植物病毒的 N e 實驗估計得出了不同的結果。獨立作用假說(IAH)指出,每個病毒體都有感染的可能性,且病毒體在感染過程中彼此獨立行動。 IAH 的一個推論是 N e 必須是劑量依賴性的。尚未報告針對植物病毒的 IAH 測試。在這裡,我們使用植物 RNA 病毒、攜帶…

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  • 類型:已發表論文
  • 日期:2022-09-02

摘要

有效族群規模(N-e)決定了遺傳漂變的強度和多種基因型共同感染的頻率,使其成為病毒演化的關鍵因素。然而,不同植物病毒的 N-e 實驗估計得出了不同的結果。獨立作用假說(IAH)指出,每個病毒體都有感染的可能性,且病毒體在感染過程中彼此獨立行動。 IAH 的一個推論是 N-e 必須是劑量依賴性的。尚未報告針對植物病毒的 IAH 測試。在這裡,我們使用植物 RNA 病毒、攜帶 GFP 或 mCherry 螢光標記的菸草蝕紋病毒 (TEV) 變種在菸草和辣椒植物中進行 IAH 感染模型測試。原發感染灶的數量隨劑量呈線性增加,類似泊松分佈。在高劑量下,含有兩種基因型的原發感染灶的發現頻率較低(<2%)。感染接種葉子的基因型系統感染該植物的機率接近 1,儘管在極少數情況下,基因型可能因被其他基因型物理包圍而被困在接種葉子中。混合基因型感染的頻率可以使用獨立作用模型根據原發感染病灶的平均數量來預測。 TEV 似乎具有獨立作用,因此 N-e 對於這種植物 RNA 病毒具有劑量依賴性。引起全身感染的病毒粒子的平均數量可能非常小,在低劑量時接近 1。 TEV 的劑量依賴性表明,除非考慮劑量效應,否則不同病毒的 N-e 估計值的比較意義不大。