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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
核糖開關是調節性 RNA 元件，通常位於某些 mRNA 的 5'-非翻譯區，並在轉錄或翻譯層級上控制基因表現。這些元件由感測器和相鄰的執行器域組成。感測器通常是與配體特異性相互作用的適體。致動器包含分別用於轉錄或翻譯調控的內在終止子或核醣體結合位點。配體結合導致核糖開關的結構重排並導致這些調節元件的呈現或掩蔽。基於這種模組化組織，核糖開關是建構基因表現合成調控系統的理想標靶。儘管用於翻譯控制的核糖開關已成功設計，但建構調節轉錄的合成元件的嘗試迄今尚未成功。在這裡，我們提出了一個用於合理設計合成核糖開關的電腦管道，它是！在轉錄層面調節基因表現。使用充分錶徵的茶鹼適體作為感測器，我們將致動器部分設計為可以折疊成功能性內在終止子結構的RNA序列。在生化表徵中，一些設計的構建體顯示出大腸桿菌中基因表現的配體依賴性控制，這表明設計核糖開關不僅可以用於翻譯調節，還可以用於轉錄調節。