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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
植物 RNA 病毒種群在受感染植物中具有高度多態性，這可能允許宿主內快速進化。為了了解菸草蝕刻馬鈴薯Y病毒（TEV）的演化，對天然宿主菸草和替代宿主辣椒中實驗演化群體的縱向樣本進行了表型表徵和遺傳分析。使用高通量 Illumina 定序和群體遺傳方法對 TEV 群體的時間和區室變異性進行量化。在測量的兩種病毒表型特徵中，毒力在新宿主中增加，但在原始宿主中下降，並且病毒量在兩種宿主中下降，儘管在新宿主中程度較小。宿主之間族群遺傳多樣性的動態也存在顯著差異。祖先宿主中的群體雜合性增加，同義突變的優勢固定，而新宿主中的群體雜合性沒有改變甚至減少，非同義突變過多。總而言之，這些觀察結果表明，定向選擇是 TEV 種群在新宿主中進化的主要進化力量，而多樣化選擇或隨機遺傳漂變可能在自然宿主中發揮基本作用。為了更好地理解這些演化動力學，我們開發了一個電腦模擬模型，其中包含突變、選擇和漂移的影響。使用先前研究的經驗數據進行參數化後，模型預測與觀察到的模式相匹配，從而強化了我們的觀點，即突變累積的經驗模式代表了適應性演化。