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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
植物人工微 RNA (amiR) 已被設計用於靶向病毒基因組並誘導其降解。然而，RNA 病毒卓越的演化可塑性威脅著這些 amiR 所賦予的抗藥性的持久性。最近的研究表明，未經歷抗病毒 amiR 強選擇壓力的病毒群體可能已經在目標序列中包含足夠的遺傳變異性，從而以幾乎確定性的方式逃避植物抗性。此外，研究還表明，暴露於亞抑制濃度的抗病毒 amiR 的病毒群體會加速這一過程。在本文中，我們描述了兩種條件下病毒基因組中 amiR 標靶序列的分子演化動力學。使用 Illumina 超深度定序使我們能夠以低至 2 x 10(-6) 的頻率識別病毒序列變異，並追蹤病毒群體出現之前和之後的時間變化！成功感染對祖先病毒具有完全抵抗力的植物。我們發現病毒基因組的 amiR 目標序列中的每個位點都存在變異，並且最終打破抗藥性的變異是從許多共存的變異中取樣的。在這個系統中，完全易感植物中的病毒進化是突變和遺傳漂變之間平衡的結果，而部分抗性植物中的進化則源於涉及突變、選擇和漂變的更複雜的動態。