聖塔非研究所

摘要 為科學和社會提供綜合的、最新的、高品質的、開放的、可複製的和可持續的植物生命樹將是一項現在觸手可及

2022-09-02 · 已發表論文 · 更新 2026/03/19 上午01:41

摘要 為科學和社會提供綜合的、最新的、高品質的、開放的、可複製的和可持續的植物生命樹將是一項現在觸手可及的巨大服務。然而,由於存在許多資訊學障礙,在公共領域合成不斷增長的 DNA 序列數據並將樹木傳播給不同的受眾通常並不容易。雖然正在建立大型合成植物系統發育樹,但它們仍然保持靜態,並且隨著新數據的發布和樹構建方法的改進而很快過時。此外,非專家很難瀏覽和取得現有的系統發育證據。我…

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  • 類型:已發表論文
  • 日期:2022-09-02

摘要

為科學和社會提供綜合的、最新的、高品質的、開放的、可複製的和可持續的植物生命樹將是一項現在觸手可及的巨大服務。然而,由於存在許多資訊學障礙,在公共領域合成不斷增長的 DNA 序列數據並將樹木傳播給不同的受眾通常並不容易。雖然正在建立大型合成植物系統發育樹,但它們仍然保持靜態,並且隨著新數據的發布和樹構建方法的改進而很快過時。此外,非專家很難瀏覽和取得現有的系統發育證據。我們建議我們的植物學家、樹木建造者和資訊學家社群應該集中在一個用於資料整合和系統發育分析的模組化框架上,以便輕鬆協作、更新、資料擷取和靈活分析。在主要機構的支持下,該管道應定期重新運行,長期儲存樹木及其元資料。透過用戶友好的前端和應用程式開發介面向全球不同的受眾提供樹木也應該是優先事項。互動式介面可用於徵求使用者回饋,從而提高資料品質並協調新資料的產生。最後,我們概述了我們建議科學界應採取的一些步驟,以實現全球系統發育綜合。