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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
無論基因組極性如何，必須合成互補意義的中間體並將其用作產生新基因組鏈的模板。取決於這些新的基因組鏈本身是否成為產生額外反基因組鏈的模板，從而產生幾何增長，或者只有首先合成的反基因組鏈可以用於此目的，因此遵循Luria的沖壓機模型，突變基因組的豐度和分佈將有所不同。在這裡，我們提出了數學和位元串模型，可以區分沖壓機和幾何複製。我們觀察到，無論適應度景觀的拓樸結構如何，隨著複製機制從純幾何切換到沖壓機器，主序列消失的臨界突變率都會增加。我們也發現，對於大範圍的突變率，無論複製方案如何，大效應突變都不會累積。然而，輕微的突變在幾何模型中累積得更多。此外，在高突變率下，幾何成長會導致突變效應中間值的群體崩潰，在該值下，沖壓機仍能產生主基因組。我們觀察到，臨界突變率弱依賴拮抗上位性的強度，但強烈依賴協同上位性。總之，我們已經證明，RNA 病毒可以透過作為沖壓機器進行複製來增強其抵抗有害突變累積的穩健性，而這種益處的大小取決於假設的適應度景觀的拓撲結構。