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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
現在可以透過各種定序技術輕鬆分析微生物組樣本中豐富的分類群和基因類別，並使用各種軟體工具進行視覺化。然而，微生物組中的類群組合與其基因內容之間存在明顯的聯繫，並且缺乏用於可視化微生物組組成的這兩個方面之間的關係以及促進對其共變進行探索性分析的工具。在這裡，我們介紹 BURRITO，一種用於微生物組多組學資料與配對分類學和功能資訊的互動式視覺化的網路工具。 BURRITO 同時視覺化多個樣本的分類和功能組成，並動態突出顯示分類單元和功能之間的關係，以捕捉這些資料的基礎結構。使用者可以瀏覽感興趣的分類單元和功能，並互動式地探索樣本中每個分類單元的每個功能的份額。 BURRITO 支援分類學和巨集基因組資料的多種輸入格式，允許調整資料粒度，並可以將生成的視覺化匯出為靜態出版就緒格式的圖形。在本文中，我們描述了 BURRITO 的功能，並提供了其實用性的說明性範例，用於可視化複雜微生物組中類群組成與功能之間關係的各種趨勢。