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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
生態位劃分的概念在生態學和傳染病進化的交叉領域受到了相當多的理論關注。菌株理論假設，病原體群體可以透過頻率依賴的選擇建構成不同的非重疊菌株，以回應宿主免疫空間的種內競爭。瘧原蟲惡性瘧原蟲為在高重組率和廣泛抗原多樣性的條件下研究自然界中的這種現象提供了機會。此寄生蟲的主要血液階段抗原 PfEMP1 由高度多樣化的 var 基因編碼。透過從加納高流行地區的無症狀病例中採集的數千個 var DBL 序列類型的數據集，我們研究了 var 多樣性在分離株內的分佈情況，並將其與分離株內微衛星等位基因多樣性的分佈進行比較，以測試基因組的抗原區域和中性區域的結構是否不同。對於 var DBL 序列類型，我們發現平均分離株的重疊度顯著低於隨機預期，但也存在高度相關的頻繁分離株對。此外，var DBL序列類型的連鎖網絡揭示了這些抗原基因特有的非隨機模組化模式，我們發現高度連鎖的DBL類型的模組不能用與var重組約束、微衛星多樣性、採樣位置、宿主年齡或感染複數相關的中性力來解釋。 var 抗原基因之間重疊和模組化減少的這些發現與菌株理論提出的免疫選擇的作用一致。確定惡性瘧原蟲抗原多樣性非隨機結構的演化和生態動力學對於設計流行地區的有效幹預措施非常重要。