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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
生態網絡，無論是互惠互利或對抗相互作用，似乎都有共同的結構特徵：嵌套性和模組化的存在。關於這些特性的重要性和影響，已經制定了各種模型方法和假設。在噬菌體-細菌二分感染網絡中，嵌套似乎是許多不同情況的規則。考慮到標準連續近似的維度和多參數性質，對不同病毒-宿主整體的協同演化進行建模是一項艱鉅的任務。在這裡，我們採取了不同的方法，在空間晶格上使用宿主噬菌體相互作用的中性玩具模型。每個個體都由一個位元串（數字基因組）表示，但每個類別中的所有串（即宿主或噬菌體）共享相同的參數集。噬菌體病毒識別規則的匹配等位基因模型足以產生一個複雜、多樣化的生態系統，具有異質的相互作用和嵌套模式，前提是相互作用發生在空間受限的環境下。研究發現，嵌套似乎是共同演化動力學的新興屬性。我們的結果表明，局部相互作用導致的多樣性增強強烈促進了嵌套感染基質的存在。