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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
由於涉及因素的多樣性和相互作用的複雜性，了解植物觸發宿主防禦病毒的機制一直是一個具有挑戰性的問題。然而，基因組技術的出現為掌握交互作用的全局圖景提供了可能性。在這裡，我們使用擬南芥來識別和比較在七種不同的 (+)ssRNA 和一種 ssDNA 植物病毒感染時受到差異調節的基因。在第一種方法中，我們建立了受每種病毒不同影響的基因列表，並比較了它們對生物功能和代謝過程的參與。我們發現，系統發育相關的病毒顯著改變相似基因的表達，而自然感染十字花科的病毒在植物反應中表現出更大的重疊。在第二種方法中，使用轉錄和蛋白質-蛋白質相互作用網絡模型將病毒調控的基因置於背景中！擬南芥的作品。我們的結果證實，宿主細胞在感染過程中對其轉錄組進行了顯著的重編程，這可能是建立宿主防禦的核心要求。我們發現了一種一般的作用模式，其中擾動優先影響高度連接、集中和組織在模組中的基因。