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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
由於涉及的因素眾多且相互作用的複雜性，病毒發病機制的分子機制仍知之甚少。我們能否辨識出一組最小的宿主轉錄因子（TF），其錯誤調節會導致在沒有病毒的情況下受感染細胞的轉錄譜特徵？這樣的集合有幾個？所有正交或共享關鍵轉錄因子是否都涉及特定的生物學功能？我們開發了一種計算方法，使用擬南芥轉錄調控網絡（TRN）的定量模型來探索所有可能的重新設計的TRN，其轉錄組圖譜模仿在受感染植物中觀察到的轉錄組圖譜。我們發現核心集包含 6 到 34 個 TF，取決於病毒，其 TRN 中的電腦敲除或過度表達導致轉錄譜與受感染植物中觀察到的轉錄譜的偏差最小。