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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
番茄黑環病毒（TBRV）是感染全世界多種植物的重要病原體。 TBRV 的系統發育研究已經進行，儘管受到使用短基因組區域或減少分離株數量的限制。在本研究中，我們基於來自不同寄主植物和歐洲地理區域的 57 種 TBRV 分離株（47 種來自波蘭、8 種來自立陶宛、1 種來自英國和 1 種來自匈牙利）的外殼蛋白基因 (CP) 序列進行了詳盡的系統發育和群體遺傳分析。此外，也分析了作用於特定密碼子的選擇壓力和CP中胺基酸殘基的共同演化。結果清楚地表明，TBRV 種群正在透過重組以及正向選擇和純化選擇而形成。分析表明，TBRV 分離株在系統發育樹中的位置不是隨機的，分離株根據寄主植物科和地理起源進行聚類。