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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
眾所周知，非酵素模板引導的分子複製子 X + nO -> k 2X 表現出拋物線生長 d[X]/dt 無限大 kX。在這裡，我們分析了有效複製速率常數 k 對雜交能量、溫度、鍊長度和序列組成的依賴性。首先，我們基於簡單的熱力學論證得出複製率 k 的分析標準。其次，我們提出了寡核苷酸的布朗動力學模型，使我們能夠模擬它們的擴散和雜交行為。此模擬用於產生和分析鍊長度、溫度以及一定程度上的序列組成對雜交速率和由此產生的最佳總體速率常數 k 的影響。結合這兩種方法使我們能夠半分析地描述模板定向複製器的複製率情況。結果表明，在較低溫度下，更長的鏈具有明顯的複製優勢！其中連接速率是限速的。此外，結果表明在兩個區域之間的邊界處存在最佳複製速率，其中連接速率和去雜交速率是速率限制的。