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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
穩健性和進化性是決定表型穩定性和可及性的主要特性。已經在許多計算基因型-表型圖譜中對它們進行了研究。在本文中，我們研究了 toyLIFE 中定義的代謝基因型-表型圖，這是一個代表簡化細胞生物學的多層次計算模型。 toyLIFE 包括多個層面的表型表達，從蛋白質到調控網絡再到新陳代謝。我們的結果表明，toyLIFE 與其他看似無關的計算基因型-表型圖譜有許多相似之處。因此，toyLIFE 在從基因型到表型的映射中表現出高度簡併性，以及表型豐度的高度傾斜分佈。與豐富表型相關的中性網絡具有高度可導航性，且常見表型在基因型空間中彼此接近。所有這些特性都是引人注目的，因為 toyLIFE 是建立在 HP 蛋白質折疊模型的一個版本之上的，該模型既不穩健也不可進化：表型不能通過點突變相互訪問。此外，穩健性和進化性都隨著基因型中基因數量的增加而增加。因此，我們的結果表明，增加基因型到表型映射的複雜性和增加基因組大小可以增強這兩個特性。