摘要 穹窿RNA (vtRNA) 是小的、大約100 nt 長的聚合酶III 轉錄物，包含在真核細胞的穹

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• 類型：已發表論文
• 日期：2022-09-02

摘要

穹窿RNA (vtRNA) 是小的、大約100 nt 長的聚合酶III 轉錄物，包含在真核細胞的穹窿顆粒中。大概由於其神秘的功能，與大多數其他非編碼 RNA (ncRNA) 家族相比，它們很少受到關注。它們較差的序列保守性使得同源搜尋即使在脊椎動物中也是一項複雜而乏味的任務。在這裡，我們報告了對後口動物中這一類快速進化的 ncRNA 的系統和全面的分析，提供了計算預測的 vtRNA 基因的全面集合。我們發現所有先前描述的 vtRNA 都位於與原鈣黏蛋白基因簇相關的保守基因組位點，這種關聯在整個顎類動物中都是保守的。在此區域經常觀察到小 vtRNA 基因簇的譜系特異性擴展。第二個 vtRNA 位點在真獸類哺乳動物中是同線性保守的。兩個真獸類基因座的 vtRNA 在啟動子結構上表現出顯著差異，解釋了它們在幾種人類癌細胞系中的差異表達模式。在硬骨魚類中，透過逆轉錄酶-聚合酶鏈反應驗證了幾種旁系同源 vtRNA 基因的表達，其中大多數（但並非全部）位於同線保守的原鈣黏蛋白基因座。