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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
精確測量適應度是演化生物學的關鍵問題，特別是在研究小效應突變時。通常認為採樣誤差和漂移會妨礙對非常小的適應度效應的精確測量。我們透過使用一種新的組合方法來測量和分析健康度來規避這些限制。我們透過在受控實驗室條件下對大量大腸桿菌進行競爭實驗，估計了三個獨立的微型 Tn10 轉座子插入突變的突變適應度效應 (MFE)。使用流式細胞儀評估來自非常大樣本的基因型頻率緩解了採樣誤差問題，而漂移的影響則透過使用大量群體和大規模重複適應度測量來控制。此外，透過祖先基因型和突變基因型之間的一組四個競爭實驗，我們能夠將適應性測量分解為四個估計的參數來解釋適應性！我們的螢光標記（α）、突變（β）、突變和標記之間的上位性（γ）以及傳遞性背離（tau）的影響。我們的方法允許我們以 2 x 10(-4) 的精度估計平均選擇係數。我們還發現突變和標記的等位基因效應之間存在微小但顯著的上位交互作用，並證實適應度效應在大多數情況下是傳遞的。出乎意料的是，我們還檢測到僅由於漂移而導致的 s 測量值的變化明顯大於預期，這表明即使在完全受控的實驗中也存在神秘的變化。總體而言，我們的結果表明，選擇係數最好理解為分佈，這代表了即使在受控實驗室條件下也可以測量選擇的精度的限制。