摘要 精確鑑定負責有效臨床感染的 HIV 1 包膜糖蛋白 (Env) 可能有助於闡明 HIV 1 傳播的

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• 類型：已發表論文
• 日期：2022-09-02

摘要

精確鑑定負責有效臨床感染的 HIV-1 包膜糖蛋白 (Env) 可能有助於闡明 HIV-1 傳播的分子基礎和設計有效的疫苗。在這裡，我們開發了隨機病毒進化的數學模型，並結合系統發育樹構建，用它來分析 3,449 個完整的 env 序列，這些序列是透過來自 102 名急性 HIV-1（B 分支）感染受試者的單基因組擴增而獲得的。從個體傳播或創始病毒進化而來的病毒環境基因通常表現出突變的泊松分佈和星狀系統發育，在病毒傳播的估計時間或附近合併成推斷的共有序列。整體而言，102 名受試者中有 78 名有單一病毒有效臨床感染的證據，另外 24 名受試者有至少兩到五種病毒有效臨床感染的證據。對傳播或早期創建的 Envs 的表型分析揭示了與來自慢性感染受試者的 Envs 一致的 CCR5 依賴性模式、掩蔽輔助受體結合區域以及對融合抑製劑 T1249 和廣泛中和抗體的同等或適度增強的抵抗力。儘管傳播的包絡膜的表型特性構成了強大的防禦能力，但病毒血症高峰之前的低多重感染和有限的病毒進化表明，HIV-1對疫苗引發的免疫反應的潛在脆弱性的窗口有限。