聖塔非研究所

摘要 細胞命運是透過基因調控網絡進行編程的,基因調控網絡執行多次計算以做出適當的決定

2022-09-02 · 已發表論文 · 更新 2026/03/19 上午03:56

摘要 細胞命運是透過基因調控網絡進行編程的,基因調控網絡執行多次計算以做出適當的決定。在電腦模擬中,進化優化模仿了大自然設計此類基因調控網絡的方式。在這篇綜述中,我們討論了這些演化方法的基本原理以及如何將它們應用於工程合成網路。我們總結了實現矽進化設計方法的基本準則,以及迭代驅動網路架構走向指定動態行為的突變和選擇算子。有趣的是,正如自然進化中發生的那樣,我們展示了間斷進化模式…

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論文資訊

  • 類型:已發表論文
  • 日期:2022-09-02

摘要

細胞命運是透過基因調控網絡進行編程的,基因調控網絡執行多次計算以做出適當的決定。在電腦模擬中,進化優化模仿了大自然設計此類基因調控網絡的方式。在這篇綜述中,我們討論了這些演化方法的基本原理以及如何將它們應用於工程合成網路。我們總結了實現矽進化設計方法的基本準則,以及迭代驅動網路架構走向指定動態行為的突變和選擇算子。有趣的是,正如自然進化中發生的那樣,我們展示了間斷進化模式的存在。此外,我們還重點介紹了使用自動化程式設計的幾個模型範例,以及用於選擇正確行為的不同目標函數。最後,我們簡要討論了基因調控網絡的模組化可設計性及其在生物技術中的潛在應用。