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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
細胞感染複數（MOI）是描述病毒體與細胞之間相互作用、預測混合基因型感染動態、了解病毒演化的關鍵參數。最近的兩項研究報告了菸草花葉病毒 (TMV) 和花椰菜花葉病毒 (CaMV) 的體內 MOI 估計，使用複雜的方法來測量兩種病毒變異體在宿主細胞上的分佈。儘管實驗方法相似，但這些研究採用了不同的 MOI 定義和估計方法。這裡，開發了新的基於模型選擇的 MOI 計算方法。制定了七個用於預測 MOI 的替代模型，其中包含越來越多的參數。對於這兩個資料集，最受支持的模型包括病毒變異體隨時間的空間分離，並且在較小程度上也涉及病毒感染細胞的聚集。然後比較了三種 MOI 估計方法：兩種！以前報道的方法和最受支持的模型。對於 CaMV 數據，所有三種方法都給出了可比較的結果。對於 TMV 數據，先前報告的方法都預測隨著時間的推移 MOI 值較低（範圍：1.04-1.23），而支持最佳的模型則預測更大範圍的 MOI 值（範圍：1.01-2.10）以及 MOI 隨著時間的推移而增加。因此，模型選擇可以識別合適的替代 MOI 模型，並提出影響共感染細胞頻率的關鍵機制。對於 TMV 數據，這會導致估計 MOI 值有明顯差異。