摘要 細胞週期基因同源區（CHR）已被確定為在晚期細胞週期基因的轉錄調控中具有重要作用的DNA元件

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• 類型：已發表論文
• 日期：2022-09-02

摘要

細胞週期基因同源區（CHR）已被確定為在晚期細胞週期基因的轉錄調控中具有重要作用的DNA元件。研究表明，此類基因受 DREAM、MMB 和 FOXM1-MuvB 控制，並且這些蛋白質複合物可以透過 CHR 位點接觸 DNA。然而，尚不清楚規範 CHR 的哪些序列變異是有功能的，以及哺乳動物基因組中基於 CHR 的調控的頻率如何。在這裡，我們定義了功能性 CHR 元素的頻譜。作為計算薈萃分析的基礎，我們識別新的 CHR 序列並編譯系統發育基序保守性以及全基因組蛋白質-DNA 結合和基因表現數據。我們鑑定了大多數晚期細胞週期基因中結合 DREAM、MMB 或 FOXM1-MuvB 的 CHR 元件。相較之下，Myband 叉頭結合位點在早期和晚期細胞週期基因中的代表性不足。我們的研究結果支持了一個通用機制：DREAM、MMB 和 FOXM1-MuvB 複合物與晚期細胞週期基因的順序結合需要 CHR 元件。總之，我們定義了哺乳動物基因組中 CHR 調節的基因組，並提供證據表明 CHR 是 DREAM、MMB 和 FOXM1-MuvB 晚期細胞週期基因轉錄調節的中心啟動子元件。