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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
細菌的快速生長取決於核醣體將 mRNA 翻譯成蛋白質的速度。編碼連續脯胺酸片段的 mRNA 會導致核醣體停滯，進而大大降低翻譯速度。這種停滯對於必須快速生長和分裂的物種尤其有害。在這裡，我們關註二脯氨酰基序 (XXPPX)，並詢問它們的流行程度是否會隨生長速度而變化。為了找到答案，我們對 35 個門的超過 3000 個細菌基因組中的此類基序進行了廣泛的調查。事實上，快速生長的物種比緩慢生長的物種編碼更少的基序，尤其是在高表達的蛋白質中。我們還在嗜熱菌中發現了許多二脯氨酰基序，其中脯氨酸可以幫助維持蛋白質組穩定性。此外，具有複雜、多細胞生命週期的細菌也編碼許多二脯胺酸基序。這在生長緩慢的黏球菌門中尤其明顯。該門中的細菌編碼許多絲氨酸-蘇氨酸激酶，以及這些激酶內潛在磷酸化位點的許多二脯氨酰基序。絲胺酸-蘇胺酸激酶參與細胞訊號傳導，並幫助調節與黏球菌多細胞性相關的發育過程。總而言之，我們的觀察表明，無論是由於生長緩慢還是嗜熱生長，對翻譯速率的選擇減弱可能會使二脯氨酰基序在與翻譯速率無關的生物過程中發揮新的作用。