本頁只刊出中文翻譯與中文說明；英文原文請見下方原文連結。
原文連結
論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
結合轉錄因子從而調節基因表現的 DNA 序列突變是基因表現適應性變異的來源。為了了解轉錄因子結合序列如何在擬南芥自然群體中演化，我們將轉錄因子結合位點的基因組多態性資料與這些轉錄因子結合親和力的體外資料整合起來。具體來說，我們研究了 1,135 份擬南芥種質中的 19 種不同轉錄因子，以及這些轉錄因子在體內結合的 8,333 個基因組位點的等位基因頻率。我們發現轉錄因子結合序列顯示出非常低的遺傳多樣性，顯示它們受到純化選擇的影響。這種結合序列的高頻等位基因傾向於強烈結合轉錄因子。相反，群體中不存在的等位基因往往與它們的結合較弱。此外，具有高頻率的等位基因也往往是通往這些等位基因的許多可接近的演化路徑的終點。我們表明，高親和力和高進化可及性都有助於至少某些轉錄因子的高等位基因頻率。儘管親和力更強的結合序列更常見，但我們沒有發現它們與更高的基因表現水平相關。改變結合親和力的各個突變之間的上位相互作用是普遍存在的，並且可以幫助解釋結合序列之間的可及性的變化。總之，將體外結合親和力數據與體內結合序列數據結合可以幫助了解影響自然群體中轉錄因子結合序列進化的力量。