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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
背景：Pipo 最近被描述為馬鈴薯病毒科成員基因組內編碼的新 ORF (PNAS 105: 5897-5902, 2008)。它嵌入 P3 順反子內，並在相對於馬鈴薯病毒長 ORF 的 +2 閱讀框中翻譯為 P3N-PIPO 融合蛋白。在這項工作中，我們首先收集了 48 種馬鈴薯Y病毒屬不同分離株的 pipo 核苷酸序列。其次，為了確定 pipo 長度變化的生物學意義，我們測量了兩種具有不同長度 pipo 等位基因的蕪菁花葉病毒 (TuMV) 變種在三種不同易感宿主物種中的感染性、病毒累積、細胞間運動和全身運動，並測試了兩種變種之間的差異。結果：除了種間變異外，物種內分離株之間的 PIPO 蛋白長度也存在很大差異（範圍為 1 至 89 個胺基酸）。此外，對 P3 順反子的選擇分析並未解釋 pipo ORF 中終止密碼子的存在，但顯示正選擇在馬鈴薯病毒 Y (PVY) 和 TuMV 的重疊區域中顯著。在某些情況下，長度的變異性與宿主物種、地理來源和/或其他菌株特徵相關。我們發現與 TuMV pipo 等位基因相關的表型之間存在顯著的經驗差異，儘管影響的幅度和跡象取決於宿主。結論：計算分子演化分析和源自這些分析的實驗相結合，提供了關於作用於不同長度 pipo 等位基因的選擇壓力的線索，並表明長度的變化可能透過宿主驅動的選擇來維持。