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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
背景：亞型間重組在三個地理區域的愛滋病毒流行中占主導地位。為了更了解 HIV 重組體在當前 HIV 流行中的作用，我們在此介紹了對 9435 個 HIV-1 序列進行大規模亞型分析的結果，其中涉及 A、B、C、G、F 亞型以及來自三大洲的流行病學上重要的重組體。結果：循環的重組形式 CRF02_AG 在中非西部常見，似乎是由亞型 A 和 G 分歧早期發生的重組事件引起的，隨後發生了其他最近的重組事件，這些重組事件促成了定義當前重組譜系的斷點模式。這項發現也糾正了最近關於 G 是 CRF02 的重組體和後代的說法，而 CRF02 被認為是純亞型。中國和南美的 BC 和 BF 重組體分別源自當代親本譜系之間最近的重組。南美洲 BF 重組體的共享斷點顯示阿根廷和巴西的 HIV-1 流行並不是獨立的。因此，當代 HIV-1 流行病具有古老和現代起源的重組譜系。結論：綜上所述，我們發現這些在當前愛滋病毒流行中非常普遍的重組譜係是古代重組和現代重組的混合體。 HIV大流行的重組形式的複雜性和流行率日益提高，有時以相關形式的「家族」形式存在。我們發現，一些 CRF 名稱的分類需要修訂，因為 (1) 洛斯阿拉莫斯序列資料庫中儲存的原始亞型分配的估計誤差 > 5%； (2) 越來越多的 CRF 被定義，但它們不容易適合分子流行病學和疫苗設計的分組； (3) 動態的愛滋病毒流行背景。