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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
背景：剪接體內含子的位置在遠端相關基因之間通常是保守的。位於非保守位置的內含子要么是新的，要么是某些進化譜系中內含子頻繁丟失的殘餘物。很難證明最近獲得了此類內含子。然而，需要驗證新穎的內含子來評估當代內含子增益過程。結果：我們在 31 個果蠅基因中鑑定出了 25 個明確的新內含子位置案例，這些基因表現出近內含子對 (NIP)。此處，NIP 由一個古老的內含子位置和一個新的內含子位置組成，兩者之間的距離小於 32 nt。在單一基因內，如此緊密間隔的內含子不太可能共存。因此，在大多數情況下，古老的內含子位置肯定已經消失，取而代之的是新的內含子位置。對 12 個果蠅基因組中的 NIP 的調查發現，內含子滑動（遷移）是新內含子位置的更常見原因之一。其他新穎的內含子似乎是透過包含原剪接位點的編碼序列的區域串聯重複獲得的。結論：最近的內含子增益有時似乎是由外顯子序列的複製和隨後的其中一個拷貝的內含子化引起的。內含子遷移和外顯子重複共同可能解釋了保守編碼序列中大量新內含子位置。