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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
背景：植物病毒的基因組編碼能力有限，為了完成其感染週期，病毒因子必須直接或間接地針對許多宿主元件。然而，人們對病毒與宿主因素之間的相互作用網絡知之甚少。馬鈴薯Y病毒屬是最大的感染植物的正鏈RNA病毒。馬鈴薯病毒核包涵體a（NIa）在感染過程中扮演多種角色。 NIA 是一種多蛋白，由兩個結構域組成，即病毒蛋白基因組連鎖 (VPg) 和蛋白酶 (NIaPro)，由一個低效利用的自蛋白水解位點分隔開。為了深入了解馬鈴薯Y病毒NIa與宿主細胞在感染過程中的相互作用，我們構建了煙草蝕紋病毒（TEV，馬鈴薯Y病毒屬）感染性克隆，其中NIa的VPg或NIaPro結構域用親和多肽Twin-Strep標籤標記，並通過親和純化和質譜分析（AP-MS）鑑定了病毒蛋白靶向的宿主蛋白。結果：我們鑑定了 232 種不同的擬南芥蛋白，它們形成複合物的一部分，其中也涉及 TEV Nia 產品。 VPg 和 NIaPro 分別特異性靶向這些蛋白質中的 89 和 76 個，而兩個結構域都靶向 67 個蛋白質，並被認為是全長 NIa 靶標。利用目前已知的擬南芥相互作用組，我們建構了 TEV Nia 結構域和 516 個宿主蛋白質之間的蛋白質相互作用網絡。 VPg 特異性標靶的連接最緊密的元件是 G-box 調節因子 6 和粒線體 ATP 合成酶 δ 亞基； NIaPro 特異性靶向的是質膜水通道蛋白 PIP2;7 和肌動蛋白 7，而全長 NIa 特異性靶向的是熱休克蛋白 70-1 和光系統蛋白 LHCA3。此外，全球擬南芥相互作用組的背景分析表明，NIa 標靶與其他宿主蛋白的連接並不比偶然預期的更多，而是處於允許它們以更短路徑與其他宿主蛋白連接的位置。對NIa靶向宿主蛋白的進一步分析表明，它們主要參與壓力反應、新陳代謝、光合作用和定位。許多這些蛋白質與植物激素乙烯有關。結論：馬鈴薯Y病毒NIa在感染過程中針對許多宿主元件，建立了一個有效傳遞訊息的網路。