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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
背景：歷史偶然性在確定病毒族群演化潛力方面的重要性在很大程度上沒有受到重視。然而，識別過去的適應所施加的限制對於理解進化生物學中的許多問題非常重要，例如多宿主病毒的宿主使用動態的進化或在缺乏抗病毒治療的情況下持續存在的逃脫突變體的出現。為了解決這個問題，我們採用了一種實驗方法，其中 60 個在過去的進化歷史和對煙草的適應程度方面不同的煙草蝕刻馬鈴薯病毒譜係被允許適應該宿主，進行 15 輪宿主內繁殖和轉移。此後，我們評估了對新宿主以及原始宿主的適應程度，並描述了每個譜系的共有序列。結果：我們發現過去的演化歷史並沒有決定這個共同宿主演化階段的表型結果，而對過去宿主的局部適應訊號基本上已經消失。相較之下，演化歷史在基因型層面上留下了足跡，因為實驗開始時出現的大多數宿主特異性突變都保留在終點群體中，並且可能影響了隨後固定的新突變。儘管共享選擇性環境，但這導致序列之間進一步分歧。結論：本實驗強化了這樣的觀點，「歷史偶然性在演化中有多重要？」這個問題的答案。很大程度取決於所研究的性狀的整合程度。發現 TEV 基因型具有強烈的歷史偶然性，而對錶型演化的影響較弱。在應用背景下，我們的結果表明病毒不容易陷入次優表型，並且（重新）出現不受進化限制。