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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
背景：系統生物學領域的研究需要用於多種目的的軟體。軟體必須用於儲存、檢索、分析，有時甚至收集從系統層級（通常是高通量）實驗獲得的數據。還必須使用軟體來實現系統級模擬和理論預測所需的數學模型和演算法。結果：我們引入了一個免費、易於使用、開源、整合的軟體平台，稱為系統生物學研究工具（SBRT），以促進系統生物學的計算方面。 SBRT 目前執行 35 種用於分析化學計量網絡的方法以及來自圖論、幾何、代數和組合學等領域的 16 種方法。新的計算技術可以透過流程插件添加到 SBRT 中，為系統生物學的軟體開發提供高度的可進化性和統一的框架。結論：系統生物學研究工具代表了系統生物學的技術進步。該軟體可用於使每個人（包括那些沒有程式設計能力的人）都可以使用複雜的計算技術，促進研究人員之間的合作，並加快系統生物學領域的進展。