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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
背景：網路主題是循環互動模式，在生物互動圖中遇到的頻率明顯高於隨機網路中的預期。它們的存在引發了關於它們的出現和功能的問題。在這種情況下，研究表明，由三個基因組成的前饋環（FFL）能夠透過以非常具體、穩健的方式做出反應來處理外部訊號，加速或延遲反應。早期研究顯示拓樸和動力學之間存在一對一的映射，但這種觀點一再受到質疑。 FFL 的功能歸因於這種特定的反應。一般的反應分析很困難，因為我們正在處理系統響應外部訊號而走向新狀態的動態軌跡。結果：我們開發了一種分析方法，使我們能夠系統地探索特定動態響應的出現模式和機率。該方法基於對系統零斜線的相當簡單但強大的幾何分析，並輔以響應機率的適當形式化。結論：我們的分析可以明確確定主題拓撲與一組潛在可實現功能之間的關係。分佈機率分佈與給定網路拓撲的專業化程度或靈活性相關。概述了複雜網路中不同主題拓撲的出現的含義。