本頁只刊出中文翻譯與中文說明；英文原文請見下方原文連結。
原文連結
論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
背景：菠菜花葉病毒（PepMV）是一種新興的植物病原體，可感染全世界的番茄。了解影響其演化成功的因素對於開發新的控制策略至關重要，這些策略可能對新病毒株的演化更有效。這些演化因素之一是突變適應度效應（DMFE）的分佈，即對給定病毒株和宿主物種致命、有害、中性和有益的突變比例。本研究的目的是表徵智利 2 株 PepMV 輕度分離株 (PepMV-P22) 引入的非同義突變的 DMFE。此外，我們也探討了給定突變的適應度效應是否取決於它出現的基因或與遺傳背景的上位交互作用。為了解決後一種可能性，在歐洲菌株（PepMV-P11）的溫和分離株中也引入了突變子集，並測量了所得克隆的適應性。結果：透過定點突變創建了 25 個 PepMV 克隆的集合，每個克隆均包含單核苷酸非同義取代，並確定了每個突變體的適合度。 PepMV-P22 基因組對點突變表現出高度的穩健性，80% 的突變是中性甚至有益的，只有 20% 是有害或致命的。我們發現突變的影響很大程度取決於引入突變的基因。平均有益效果最大的突變是影響 RdRp 基因的突變，而影響 TGB1 和 CP 基因的突變則平均效果是有害的。此外，在非同義突變和遺傳背景之間觀察到顯著的上位交互作用，這意味著給定核苷酸取代對特定基因組背景的影響無法透過了解其在不同基因組背景中的影響來預測。結論：我們的結果表明 PepMV 基因組對突變具有令人驚訝的高穩健性。我們還發現，所分析的兩種菌株之間給定突變的適應度結果有所不同。這項發現表明，PepMV 株之間的選擇強度和演化速度各不相同。