摘要 背景：菠菜花葉病毒（PepMV）被認為是全世界感染番茄的最危險的病原體之一

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• 類型：已發表論文
• 日期：2022-09-02

摘要

背景：菠菜花葉病毒（PepMV）被認為是全世界感染番茄的最危險的病原體之一。該病毒高度多樣化，已經描述了四種不同的基因型以及株間重組體。這些分離株在受感染的植物物種上表現出多種症狀，從輕度花葉到嚴重壞死。然而，人們對 PepMV 分子演化的機制和模式以及單一蛋白質在宿主-病原體相互作用中的作用知之甚少。方法：對症狀學和地理起源不同的 PepMV 分離株的三基因塊 3 (TGB3) 的核苷酸序列進行了分析。透過評估特定胺基酸殘基在多樣化過程中所受到的選擇性限制，研究了 TGBp3 蛋白的分子演化模式和模式。 TGBp3 蛋白的三維結構已使用 Rosetta 演算法從頭建模。分析了症狀發展與特定胺基酸殘基位置之間的相關性。結果：結果表明，TGBp3 主要在多個胺基酸位點上的純化選擇作用下進化，從而突出了其在 PepMV 感染過程中的功能作用。有趣的是，先前已被證明是壞死決定簇的氨基酸 67 被發現處於正選擇之下。結論：鑑定 TGB3p3 中的多種選擇事件將有助於揭示其生物學功能，並且對於了解 Potexvirus 基因組的演化限制至關重要。 TGBp3 的三維結構估計將作為進一步序列、結構和功能分析的平台，並將刺激新的實驗進展。