摘要 背景：血吸蟲是扁形動物門的吸蟲寄生蟲

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• 類型：已發表論文
• 日期：2022-09-02

摘要

背景：血吸蟲是扁形動物門的吸蟲寄生蟲。就發病率和死亡率而言，它們被認為是最重要的人類蠕蟲寄生蟲。曼氏血吸蟲和日本血吸蟲的基因組序列草案現已提供。非編碼 RNA (ncRNA) 在基因表現調控、細胞功能和防禦、體內平衡和發病機制中發揮著至關重要的作用。 ncRNA 的全基因組註釋是一項艱鉅的任務，除非已經有密切相關物種的註釋良好的基因組。結果：對曼氏鏈黴菌基因組中的結構化 ncRNA 進行同源搜索，得到了 23 種具有保守一級和二級結構的 ncRNA。其中，我們鑑定出 rRNA、snRNA、SL RNA、SRP、tRNA 和 RNase P，也可能鑑定出 MRP 和 7SK RNA。此外，我們也確認了最近在日本血吸蟲中報告的 5 個 miRNA，並發現了另外兩個已知 miRNA 的同源物。曼氏鏈球菌的 tRNA 補充與自由生活的渦蟲 Schmidtea mediterranea 相當，儘管觀察到某些氨基酸的差異超過兩倍：曼氏鏈球菌中 Leu、Ser 和 His 的比例過高，而 Cys、Meth 和 Ile 的比例不足。另一方面，日本血吸蟲基因組的 tRNA 數量減少了四倍以上。兩種血吸蟲都有一套完整的小剪接體 snRNA。曼氏鏈黴菌基因組中預期存在的幾種 ncRNA 並未被發現，包括端粒酶 RNA、vault RNA 和 Y RNA。結論：這裡提供的 ncRNA 序列和結構代表了迄今為止所報導的冠輪動物最完整的 ncRNA 資料集。此資料集為進一步分析血吸蟲基因組乃至整個真核生物基因組提供了重要參考。