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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
背景：轉錄網路定義了細胞生命調節機制的核心，主要負責資訊處理和決策。在小規模上，互動主題已根據其豐富性進行了表徵，並描述了一些看似普遍的模式。特別是，基因調控網路中大量不同的前饋環基序顯示出對某些特定拓撲的系統偏差，這些拓撲比其他拓撲更常見。這種模式的發生過程仍有爭議。結果：我們使用先前工作中開發的形式分析了前饋循環的整個主題功能景觀。我們評估了每個主題實現可能功能的機率，發現這些分佈的峰度與自然豐度模式密切相關。峰度是機率分佈峰值的標準度量。此外，我們在計算機中檢查了面臨突變壓力的基序的功能穩健性，並觀察到豐度模式因其進化程度而存在偏差。結論：前饋迴路的自然豐度模式可以根據其內在的可塑性進行重建。內在可塑性與每個主題的實現一系列可能功能的能力有關，並且與主題的進化性直接相關。由於進化性被定義為突變時基序的潛在表型變異，因此這種連結似乎可以解釋豐度模式。