本頁只刊出中文翻譯與中文說明；英文原文請見下方原文連結。
原文連結
論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
背景雖然目前幾項大規模研究已經很好地描述了腸道微生物組的組成，但仍缺乏能夠解釋已觀察到的微生物組組成範圍的模型。競爭性彩票模型是一種在宏觀社區中得到充分研究並且可能有助於理解微生物組組裝的模型。該模型假設來自區域物種庫的生物群體能夠在同一個生態位中定居，並且第一個到達的物種將接管整個生態位，排除其他群體成員。結果在這裡，我們檢查了該模型是否也在人類腸道微生物組的組裝中發揮作用，定義了識別在樣本中分佈符合競爭性彩票模式的生物群體的措施。將此模型應用於包含數千個人類腸道微生物組樣本的多個資料集，我們確定了幾個表現出彩票狀分佈的分類群，包括 Akkermansia、Dialister 和 Phascolarctobacter 屬。我們驗證了這些群體在多個獨立的微生物組數據集中表現出類似彩票的組裝，確認這種組裝模式是通用的，而不是特定於隊列的。透過檢查這些群體的物種在發育中嬰兒腸道微生物組中的分佈，我們發現最初的彩票獲勝者可以被該群體的其他成員取代。我們進一步發現，來自類似彩票群體的物種往往在其基因組中具有較少的基因，這表明更專業的物種不太能夠參與生態位分化。結論 綜上所述，我們的研究結果強調了微生物群落聚集的複雜和動態過程，並表明不同的系統發育群體在此過程中可能遵循不同的模型。