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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
許多RNA家族，即同源RNA基因組，屬於RNA類別，例如tRNA、snoRNA或microRNA，其特徵在於共同的序列基序和/或共同的二級結構特徵。 RNA 類別新成員的檢測以及 RNA 類別成員的基因組綜合註釋是一項具有挑戰性的任務，超出了簡單的同源性搜尋範圍。解決此問題的計算方法通常使用三層方法：第一步採用高效且靈敏的濾波器。在第二步驟中，使用針對特異性的計算昂貴的方法來縮小候選集的範圍。在最後一步中，以特定於類別的特徵對命中進行註釋並評分。在這裡，我們回顧一下目前可用於多種 RNA 類別的工具。