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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
許多小核仁 RNA 和許多 miRNA 的髮夾前體是由長非蛋白編碼 (lncRNA) 宿主基因加工而成。與其高度保守和結構嚴謹的有效負荷相反，宿主基因的序列保守性較差。儘管如此，越來越多的證據顯示宿主基因具有生物學功能。宿主基因的功能與其有效負荷的功能之間沒有明顯的關聯。在這裡，我們研究宿主基因功能或機制是否與有效負荷類型相關。為了評估這個假設，我們測試了 miRNA 宿主基因 (MIRHG)、snoRNA 宿主基因 (SNHG) 和其他 lncRNA 宿主基因是否可以根據序列和結構特徵進行區分。肯定的答案意味著宿主基因與其有效負荷之間存在相關性。雖然當分類器允許從有效負載中提取特徵時，可以可靠地區分這三個類別，但當僅使用遠離 snoRNA 或 miRNA 有效負載的宿主基因部分的序列和結構進行分類時，情況就不再是這樣了。因此，我們得出結論，MIRHG 和 SNHG 不會形成彼此不同或與沒有有效負載的 lncRNA 不同的單獨的非編碼 RNA 類別。