摘要許多高通量定序研究都集中在檢測 RNA seq 數據中的常規剪接 mRNA｜聖塔非研究所

摘要許多高通量定序研究都集中在檢測 RNA seq 數據中的常規剪接 mRNA

2022-09-02 · 已發表論文 · 更新 2026/03/19 上午03:22

摘要許多高通量定序研究都集中在檢測 RNA seq 數據中的常規剪接 mRNA。然而，透過基因融合、環化或反式剪接產生的非標準RNA常常被忽略。我們引入了一種新穎的、無偏差的演算法來檢測單端 cDNA 序列的剪接點。與其他方法相比，我們的方法適應多結結構。我們的方法與傳統剪接 mRNA 的競爭工具相比具有優勢，並且召回率提高了高達 40%，在多次分割、反式剪接和環狀產物的讀取…

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論文資訊

類型：已發表論文
日期：2022-09-02

摘要

許多高通量定序研究都集中在檢測 RNA-seq 數據中的常規剪接 mRNA。然而，透過基因融合、環化或反式剪接產生的非標準RNA常常被忽略。我們引入了一種新穎的、無偏差的演算法來檢測單端 cDNA 序列的剪接點。與其他方法相比，我們的方法適應多結結構。我們的方法與傳統剪接 mRNA 的競爭工具相比具有優勢，並且召回率提高了高達 40%，在多次分割、反式剪接和環狀產物的讀取方面系統地優於它們。