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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
透過細胞內相分離形成液滴的蛋白質的一個關鍵特徵是存在多個位點（多價性），介導與其他蛋白質的相互作用。我們對進化時間尺度上多價的變化知之甚少。在這裡，我們研究了真菌 mRNA 脫帽亞基 2 蛋白 (Dcp2) 和 FET 蛋白家族多價性的長期演化（約 6 億年）。我們發現這些蛋白質的直系同源物之間的多價性差異很大。然而，演化保持了使蛋白質-蛋白質相互作用發生的序列基序的長度尺度。也就是說，每百個胺基酸中此類基序的總數比中性進化預期的更高且變化更小。為了幫助解釋這種演化守恆，我們使用機器學習演算法開發了一種構象分類器。此分類器顯示 Dcp2 和 FET 蛋白中的無序片段傾向於採用緊密的構象，這對於相分離是必要的。因此，我們檢測到的進化保守性可能有助於蛋白質保持相分離的能力。總而言之，我們的研究表明，多價相互作用的長度尺度是真菌和脊椎動物中兩類相分離蛋白的進化保守特徵。