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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
進化病毒學中的一個長期觀察是，RNA 病毒族群具有高度多態性，由多種基因型混合物組成，其族群中的豐度取決於適應性差異、突變耦合和遺傳漂變之間的複雜相互作用。很久以前就表明，儘管在細胞培養中，大多數這些基因型的適應度低於它們所屬的群體，這一觀察解釋了為什麼單病毒粒子傳代會打開穆勒的棘輪，而非常大的群體傳代會導致新環境中適應度的增加。在此，我們報告了一項實驗的結果，該實驗專門設計用於評估植物 RNA 病毒菸草蝕斑病毒 (TEV) 克隆群體的亞克隆成分之間的適應性差異。透過對局部病變宿主進行感染性測定，獲得了來自 TEV 克隆群體的 100 多個單獨的生物亞克隆，這些亞克隆很好地適應了天然菸草宿主。然後，相對於從起始克隆群體中獲得的大量隨機樣本的適應性，在菸草感染期間評估這些亞克隆的複製適應性。在接種後逐漸增加的天數中評估健康狀況。我們發現，在早期，亞克隆的平均適應度明顯低於克隆群體的適應度，證實了先前的觀察結果，即大多數亞克隆都含有有害突變。然而，隨著病毒複製天數的增加，群體規模呈指數級增長，產生更多有益和補償性突變，選擇在優化適應度方面變得更加有效，亞克隆和群體之間的差異消失了。