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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
達爾文相信地球上的所有生物都是相關的，並且相關性圖是樹形的，這已經通過首先從形態學、後來從分子測序獲得的數據進行系統發育重建得到了基本上證實。隨著越來越多的序列資訊變得可用，人們認識到系統發育樹概念的局限性。達爾文的另一個開創性思想，即種群中更適應變異的自然選擇，被轉化為簡單的數學形式，並擴展到突變選擇動力學。在這種形式下，該理論可直接應用於體外RNA演化和病毒演化。 RNA 的系統發育和族群動態為演化提供了互補的見解，本章將探討這兩個概念之間的相互作用。理解演化的兩種策略最終透過結構生物學的中心範式連結：序列⇒結構⇒功能。我們詳細闡述了複製和突變驅動的 RNA 系統發育和進化建模的最新技術。因此，重點將放在系統發育序列進化模型以及 RNA 結構的進化和設計上，並提供選定的例子和模擬方法的註釋。在這些觀點中，試圖將分子結構、族群動態和系統發育結合起來模擬演化。