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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
酵母培養物中的代謝自同步凸顯了我們對基本細胞過程的理解的重大差距。這種振盪滲透到整個細胞生理學中，轉錄組在編碼生物合成和生長、分解代謝和壓力反應的基因表現之間振盪。然而，較長的蛋白質半衰期抑制了轉錄本豐度的波動，而假定的功能仍然難以捉摸。我們分析了超過 2.5 個週期的短週期呼吸振盪（約 36 分鐘，菌株 IFO 0233）的 RNA-seq 時間序列，先於系統動力學的明顯分叉。對代謝動力學和共表達群體的綜合分析確定二氧化碳和碳酸酐酶透過從分解代謝到合成代謝的前饋在振盪和培養同步中發揮推定作用。生物合成和分解代謝蛋白組轉錄的相對持續時間的差異調節發生在分叉之前，這與生長速率依賴性細胞資源分配中的因果作用相一致。蛋白質編碼轉錄本的時間程序編碼細胞的空間結構。我們提出週期性轉錄在生長細胞的亞細胞模式形成中的功能。