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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
酵母菌中的端粒酶 RNA 很大，通常 >1000 nt，並且包含已在多個不同物種中進行了廣泛實驗研究的功能元件。然而，它們很難透過基於同源性的方法檢測到，並且迄今為止在大多數糖菌亞門基因組中都逃脫了註釋。這是在核苷酸層面上快速進化的序列的結果，其大小變化很大，並且其二級結構具有高度可塑性。在此，我們報告了一項旨在縮小 RNA 註釋差距的調查。儘管付出了巨大的努力並結合了多種不同的方法，但只取得了部分成功。雖然鑑定出了 27 個新的端粒酶 RNA，但我們不得不將我們的努力限制在糖酵母亞組上，因為即使是這個狹窄的亞組也足夠多樣化，需要針對不同的系統發育亞組使用不同的搜尋模型。糖菌亞門更遠的分支仍然沒有註釋的端粒酶RNA。