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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
關於病原體菌株之間宿主競爭的現有理論提出，免疫選擇可以導致由離散的、弱重疊的抗原庫組成的菌株結構的維持。這種應變理論的預測與生態學中關於生態位劃分和生態系統中共存物種之間的限制相似性的基本思想在概念上有重疊，這些基本思想反對中性共存的假設。對於惡性瘧原蟲，菌株理論是針對血液階段的主要表面抗原（稱為 PfEMP1）專門提出的，由稱為 var 基因的多拷貝多基因家族編碼。對西非 Bakoumba 當地人群 var 基因 DBLa 結構域的深度採樣已完成，以確定在高異交（瘧疾傳播嚴重地區的特徵）的反對力量下，基因庫重疊模式是否支持免疫選擇的作用。使用 454 高通量定序方案，我們報告了 DBLa 結構域的極高多樣性和具有 DBLa 庫的大型寄生蟲族群，其結構形成非隨機重疊模式。這種族群結構對於在局部層面構成其的var基因的高度多樣性具有重要意義，支持以不同var基因庫為特徵的「菌株」的存在。非中性、依賴頻率的競爭將發揮作用，並可能成為這些模式的基礎。透過模擬類似於大規模藥物管理的干預的計算實驗，我們認為觀察到的庫結構對於乾預後剩餘的寄生蟲種群的抗原變異多樣性很重要。