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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
雖然對蛋白質家族進化史的研究很常見，但對 microRNA 和一些 snoRNA 以外的非編碼 RNA 知之甚少。在這裡，我們詳細研究了後生動物完全或部分定序的基因組中九個剪接體 snRNA 家族（U1、U2、U4、U5、U6、U11、U12、U4atac 和 U6atac）的演化史。在所有基因組中都發現了五種主要剪接體 snRNA 的代表。在線蟲或 Oikopleura dioica 的鳥槍痕跡中均未檢測到任何次要剪接體 snRNA，而在所有其他動物基因組中，至多其中一個缺失。儘管snRNA在大多數基因組中以多個拷貝存在，但可區分的旁系同源群體在長時間的進化過程中並不穩定，儘管它們獨立地出現在幾個進化枝中。一般來說，動物 snRNA 二級結構是高度保守的，儘管昆蟲中的 U 1 1 和 U12 表現出顯著的變化。對 snRNA 基因組背景的分析表明，它們的行為類似於移動元件，表現出很少的同線保守性。