報 每日報告新聞網
聖塔非研究所

摘要 革蘭氏陰性植物病原細菌野油菜黃單胞菌 pv

2022-09-02 · 已發表論文 · 更新 2026/03/19 上午03:42

摘要 革蘭氏陰性植物病原細菌野油菜黃單胞菌 pv。 vesicatoria (Xcv) 是闡明與宿主相互作用的機制的重要模型。為了深入了解 Xcv 菌株 85 10 的轉錄組，我們採用了差異 RNA 定序 (dRNA seq) 方法。使用一種新方法自動產生全面的轉錄起始位點 (TSS) 圖譜，我們報告了 Xcv 基因組中的 1421 個假定的 TSS。 Xcv 中的基因表現出保…

SFI 頁面

本頁只刊出中文翻譯與中文說明；英文原文請見下方原文連結。

原文連結

論文資訊

  • 類型：已發表論文
  • 日期：2022-09-02

摘要

革蘭氏陰性植物病原細菌野油菜黃單胞菌 pv。 vesicatoria (Xcv) 是闡明與宿主相互作用的機制的重要模型。為了深入了解 Xcv 菌株 85-10 的轉錄組，我們採用了差異 RNA 定序 (dRNA-seq) 方法。使用一種新方法自動產生全面的轉錄起始位點 (TSS) 圖譜，我們報告了 Xcv 基因組中的 1421 個假定的 TSS。 Xcv 中的基因表現出保守性較差的 -10 啟動子元件，並且沒有共有的 Shine-Dalgarno 序列。此外，14% 的 mRNA 是無前導序列，其中 13% 具有異常長的 5'-UTR。 Northern 印跡分析證實 Xcv 中有 16 個基因間小 RNA 和 7 個順式編碼的反義 RNA。八個基因間轉錄物的表達由 HrpG 和 HrpX 控制，它們是 Xcv III 型分泌系統的關鍵調節因子。更詳細的表徵確定 sX12 是一種小 RNA，透過影響內部結構來控制 Xcv 的毒力！病原體及其寄主植物的作用。 Xcv 的轉錄格局出乎意料地複雜，具有豐富的反義轉錄物、替代 TSS 和進化枝特異性小 RNA。