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論文資訊
- 類型:已發表論文
- 日期:2022-09-02
摘要
預測植物病毒的出現取決於確定決定遺傳變異在主要宿主內以及潛在新宿主之間分佈的因素。確定以下因素至關重要:(i)突變適應度效應(DMFE)在主要宿主上的分佈,(ii)它在不同宿主上如何變化,(iii)多個突變在確定主要宿主中的病毒適應度時相互作用的方式,以及(iv)這種相互作用是否依賴於宿主。為了說明 (i) 和 (ii) 點,本文回顧了最近的報告,這些報告表明馬鈴薯Y病毒的 DMFE 在天然宿主和非天然宿主之間存在顯著差異。適應度遺傳變異數的變化是相關宿主之間觀察到的模式的主要原因,而符號多效性主要解釋了不相關宿主之間觀察到的差異。為了說明第(iii)點,對顯示馬鈴薯Y病毒基因組中的隨機突變對之間顯著上位性的實驗進行了評論。很大一部分的交互作用對應於倒數符號上位性,這意味著兩個基因座的突變效應的符號是相互依賴。最後,為了說明第(iv)點,所提出的證據顯示RNA病毒的上位交互作用在宿主之間存在差異,在主要宿主中上位性的幅度較強,但隨著宿主的分類相關性降低而變得較弱。所有這些相互作用的存在危及對給定突變的適應性和進化命運的預測,因為它不僅取決於遺傳背景,還取決於病毒複製的宿主。