摘要 預測演化變化帶來了許多挑戰

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• 類型：已發表論文
• 日期：2022-09-02

摘要

預測演化變化帶來了許多挑戰。在這裡，我們利用模型細菌螢光假單胞菌，其中確定適應性「皺紋傳播者」（WS）類型進化的基因型到表型圖譜是已知的。我們提出了三種必要的調控途徑的數學描述，並用它們來預測每種突變途徑的使用率和預期的突變目標。為了測試預測，確定了每個途徑的突變率和目標。意想不到的突變熱點導致實驗觀察結果偏離預測，但額外的數據導致了完善的模型。由於先前未檢測到的引起 WS 的突變的適應性較低，在經過選擇和未經選擇時獲得的引起 WS 的突變譜之間觀察到不匹配。我們的研究結果有助於開發預測演化的機制模型，強調當前的局限性，並引起人們對預測基因座特異性突變偏差和適應度效應的挑戰的關注。